66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3837 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 178 aa  337  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  49.43 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  59.68 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  47.95 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  60.38 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  40 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  36.17 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 188 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  40.68 
 
 		 204 aa  51.6  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 202 aa  51.2  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  48.98 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  36.99 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  39.19 
 
 		 201 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 237 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  39.19 
 
 		 201 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  39.19 
 
 		 201 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 259 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 259 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 259 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  39.19 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2869  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 203 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  35.59 
 
 		 186 aa  42  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 185 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 218 aa  42  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 240 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  34.48 
 
 		 196 aa  41.2  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 207 aa  41.2  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 211 aa  41.2  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 201 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 210 aa  40.8  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 218 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 218 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 218 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 196 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 196 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 186 aa  40.8  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 196 aa  40.8  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>