More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4264 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  362  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  57.06 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  56.11 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  54.37 
 
 		 193 aa  174  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  48.66 
 
 		 186 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  49.43 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  45.11 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  53.64 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 166 aa  94.4  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  36.46 
 
 		 189 aa  91.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.88 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  34.88 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 428 aa  72  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  39.44 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  41.46 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  41.18 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 429 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  32.72 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  36.17 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  32.1 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  34.58 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 424 aa  52  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  33.1 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 245 aa  51.2  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 223 aa  51.2  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  38.98 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2060  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.94 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 367 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>