123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0532 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  413  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  44.32 
 
 		 247 aa  121  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  29.5 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  36.73 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 429 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  50.91 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  63.64 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  52.83 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  46.55 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 187 aa  52  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  38.57 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  49.02 
 
 		 241 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 178 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3241  putative regulator  36.13 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0950975 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.81 
 
 		 178 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 178 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  38.81 
 
 		 178 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 414 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  41.67 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  56.52 
 
 		 415 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 428 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 248 aa  45.1  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0147  transcriptional regulator, TetR family  23.87 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 222 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  39.29 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3625  putative transcriptional regulator, TetR family  53.66 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.679664  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  38.98 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38050  hypothetical protein  59.46 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>