115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2264 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  27.27 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  25.91 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 187 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  39.22 
 
 		 193 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 189 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.46 
 
 		 178 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 178 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  41.46 
 
 		 178 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 187 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  32.91 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  43.64 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  36.84 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 429 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  32.93 
 
 		 278 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 225 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0410  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.71 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.71 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  35.09 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  38.89 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  36.36 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  41.18 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 166 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 184 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>