111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0410 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0410  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  29.51 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.9 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  42.11 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.9 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  30.16 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  30.16 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  30.16 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  28.8 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  28.8 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 263 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  30.16 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  29.41 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 209 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 242 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0088  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  45.1 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  38.18 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 245 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  24.06 
 
 		 212 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  20.51 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 224 aa  42  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  30.56 
 
 		 202 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 216 aa  42  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 258 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 235 aa  42  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  30.56 
 
 		 202 aa  42  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  30.56 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  30.56 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  30.56 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  30.56 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 258 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  30.95 
 
 		 194 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 250 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 226 aa  41.6  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 245 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 245 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 228 aa  41.6  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10782  hypothetical protein  28.38 
 
 		 213 aa  41.6  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.882967 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 217 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  29.58 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 218 aa  41.6  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 228 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 235 aa  41.6  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>