124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6843 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  476  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  65.78 
 
 		 258 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  65.78 
 
 		 258 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  65.74 
 
 		 225 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 223 aa  248  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  26.62 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 189 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 285 aa  52.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 477 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 477 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 277 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  21.84 
 
 		 205 aa  49.3  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0799  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126774  normal  0.374704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 275 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 275 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 189 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 187 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  30.34 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 188 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 183 aa  45.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0410  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  31 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0811  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.646976  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  24.29 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  24.29 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  24.29 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  24.29 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  24.29 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  24.29 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4569  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000147437  normal  0.0336832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  30.34 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  30.34 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  30.34 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  30.34 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 192 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6653  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  0.0271875 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 194 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 192 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 196 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  28.87 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>