267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3979 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  65.91 
 
 		 187 aa  218  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  59.2 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  63.95 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  60.56 
 
 		 181 aa  198  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  54.8 
 
 		 181 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  53.44 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 182 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 178 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 178 aa  148  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 178 aa  148  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  40.34 
 
 		 178 aa  148  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  40.34 
 
 		 178 aa  148  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.34 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  40.34 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  40.34 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  45.3 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  41.01 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  41.48 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  44.79 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  37.87 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  42.07 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  33.51 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  35.62 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  35 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  43.18 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  42.11 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
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NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 428 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  35 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  37.31 
 
 		 241 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  32.2 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 414 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  36.92 
 
 		 233 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 235 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  30.82 
 
 		 186 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
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NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
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NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
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NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  30.25 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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