More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1293 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  440  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 235 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  28.64 
 
 		 220 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  29.56 
 
 		 220 aa  94  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 245 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  32.93 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  27.18 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 239 aa  88.2  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 241 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 241 aa  85.5  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  29.59 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
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NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  28.14 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  26.7 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  32.06 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  27.38 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  52.94 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
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NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
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NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  27.4 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  28.04 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
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NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
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NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
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NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
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