More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1784 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0178  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  45.6 
 
 		 199 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37080  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 192 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.83 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  31.45 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 194 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  24.14 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  24.14 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 181 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  22.9 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  32.67 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  30.34 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 193 aa  52.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 209 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 176 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 190 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  52  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  26.03 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 198 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 188 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  27.17 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 191 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 200 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 208 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>