152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0178 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0178  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  48.33 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 212 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 188 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 188 aa  52  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 188 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 188 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 188 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 212 aa  52  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37080  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 206 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 190 aa  48.5  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  21.67 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  31.97 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  21.67 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  41.43 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  21.67 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  21.67 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 175 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 189 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  27.74 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  24.3 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 421 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  32.79 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>