More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1053 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  25.43 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0178  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 256 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 255 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  29.33 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37080  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 307 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  50 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>