More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2595 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
218 aa  441  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
220 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 
207 aa  98.2  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  34.6 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
223 aa  72  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  33.82 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 
325 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 
214 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  27.62 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 
219 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  29.44 
 
 
240 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
189 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
189 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
216 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
216 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
216 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
194 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
188 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 
203 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  24.83 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 
168 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  33.02 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
125 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  43.08 
 
 
232 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
217 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 
213 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
210 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
220 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  30.89 
 
 
264 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
242 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
202 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
446 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
194 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
205 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  33.77 
 
 
211 aa  45.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 
188 aa  45.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 
217 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 
190 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
228 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  32.05 
 
 
224 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
190 aa  45.4  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
248 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 
210 aa  45.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
235 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 
229 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
219 aa  45.1  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  38.71 
 
 
205 aa  45.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 
203 aa  45.1  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
197 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  28.72 
 
 
212 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
191 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 
222 aa  45.1  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>