More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0439 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  424  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  96.59 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  72.68 
 
 		 207 aa  310  9e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1655  TetR family transcriptional regulator  69.27 
 
 		 207 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.928806  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1311  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 280 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 324 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0168  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  53.19 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  37.89 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  46.15 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 224 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 224 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 255 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 247 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 222 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  52.17 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>