More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5762 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  413  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6337  TetR family transcriptional regulator  58.71 
 
 		 202 aa  207  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  30.05 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  28.02 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  29.9 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 470 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.05 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 125 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  36.62 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.23 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 309 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3914  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201642  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  33.9 
 
 		 239 aa  45.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 271 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.68 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  29.6 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.68 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0578  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 227 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.68 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>