209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3160 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 223 aa  93.2  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  30.43 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6337  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  29.17 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4042  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229679  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  31.22 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 398 aa  52.8  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 270 aa  51.6  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 241 aa  51.6  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 188 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  44.07 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0041  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4202  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  36.25 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  38.46 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  26.32 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 393 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  26.89 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>