158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4233 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  393  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4202  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 325 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  47.69 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  29.76 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  32.04 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  38.78 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  25.88 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5224  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  32.73 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 242 aa  45.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  43.14 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  34.35 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  65.71 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  48.89 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  40.74 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 245 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6337  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>