225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2788 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  96.73 
 
 		 214 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  42.79 
 
 		 325 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  33.95 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  39.15 
 
 		 240 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  36.41 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 220 aa  101  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 212 aa  91.3  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  32.44 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  35.12 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4042  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229679  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3134  hypothetical protein  30.62 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.744862  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6337  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.96 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4202  transcriptional regulator, TetR family  50.7 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38380  putative transcriptional regulator  40.79 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0126427 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.71 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 470 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  35.71 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  38.71 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 237 aa  45.1  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 445 aa  45.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 412 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.58 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 231 aa  45.1  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 207 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 412 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  37.78 
 
 		 200 aa  45.1  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 412 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>