More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1083 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1189  regulatory protein TetR  30.5 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3493  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 247 aa  71.2  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  29.35 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3453  transcriptional regulator TetR family  31.58 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  27.5 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1818  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671958  normal  0.199135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0185  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  42.31 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  23.81 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>