More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0571 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  99.07 
 
 		 451 aa  860    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  99.77 
 
 		 451 aa  864    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 428 aa  865    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  64.49 
 
 		 408 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  63.53 
 
 		 410 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  40.93 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 396 aa  182  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 385 aa  177  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  29.78 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 425 aa  136  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 363 aa  130  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 394 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 394 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 394 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 220 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 393 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 193 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 190 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 222 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 206 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8904  putative transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 204 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 215 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 199 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 197 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  28.02 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 240 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 221 aa  57  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 254 aa  57  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 213 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 160 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 206 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 224 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 217 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 196 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 216 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  35.8 
 
 		 227 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 213 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 211 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 224 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 213 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 291 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 224 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 224 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 196 aa  53.9  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 224 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 310 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 192 aa  53.5  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 195 aa  53.5  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 222 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 193 aa  53.1  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 222 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 206 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 193 aa  53.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 238 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 226 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 195 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 216 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0815  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 204 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 196 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 228 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 178 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 207 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 223 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 191 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 191 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>