104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0336 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0336  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153342  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0346  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0325  TetR family transcriptional regulator  97.52 
 
 		 202 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3393  TetR family transcriptional regulator  62.23 
 
 		 193 aa  241  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1903  TetR family transcriptional regulator  65.92 
 
 		 208 aa  240  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.712719  normal  0.266183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 263 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 239 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 383 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  25.22 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  23.26 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  24.65 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  32.04 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3449  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  44.7  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178666  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0048  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  28.11 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 195 aa  42  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 206 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 216 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 200 aa  42  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  35.48 
 
 		 217 aa  42  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1028  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 189 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 222 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 212 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  31.48 
 
 		 248 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  28.81 
 
 		 195 aa  42  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5224  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 207 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 227 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 206 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 223 aa  42  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 245 aa  42  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 212 aa  41.2  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 183 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  21.62 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>