More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0392 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  387  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  64.18 
 
 		 237 aa  234  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  58.95 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  36.87 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  37.37 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 209 aa  91.3  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  45.61 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  39.83 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  39.78 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 226 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3774  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  28.87 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 225 aa  51.2  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 286 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  29 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  33.62 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5105  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 72 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 254 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>