208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3774 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3774  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 191 aa  257  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  31.21 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  32.82 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  41.1 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 295 aa  52  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  42.67 
 
 		 231 aa  51.6  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  47.06 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  37.78 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 268 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  39.68 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  35.8 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 242 aa  45.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 233 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  33.78 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 188 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 229 aa  44.7  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2692  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  36.14 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>