More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1826 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
250 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  95.09 
 
 
224 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  90.18 
 
 
224 aa  348  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  91.52 
 
 
224 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4138  TetR family transcriptional regulator  95.09 
 
 
224 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  79.37 
 
 
226 aa  296  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3206  TetR family transcriptional regulator  85.2 
 
 
227 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03806  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 
206 aa  115  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
209 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  36.95 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
218 aa  108  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2697  transcriptional regulator, TetR family  44.5 
 
 
195 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366203  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
215 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  32.37 
 
 
215 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 
205 aa  92.4  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5945  regulatory protein, TetR  31.09 
 
 
216 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.542251  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6435  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253012  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 
191 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 
194 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
200 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1856  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
185 aa  56.2  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
210 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
203 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 
198 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 
212 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
213 aa  55.1  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  37.5 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  27.96 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  18.9 
 
 
184 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 
199 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
208 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
211 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
218 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
218 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
218 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 
208 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 
295 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
221 aa  52.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 
205 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
235 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 
197 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 
190 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
201 aa  52  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
195 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
195 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
195 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
197 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  54.17 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
207 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
192 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  40.35 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
192 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
203 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
213 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  39.39 
 
 
191 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
226 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 
210 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 
194 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 
201 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 
201 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 
190 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
186 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
211 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  56.25 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
198 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 
205 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
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NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
197 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0279876 
 
 
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NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
203 aa  49.7  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal 
 
 
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NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
191 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 
218 aa  49.3  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 
189 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 
195 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
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