127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4551 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  100 
 
 		 217 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  34.16 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  29.95 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  29.72 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4042  transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229679  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  29.25 
 
 		 238 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  46.75 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 245 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  44.93 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 261 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 275 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4006  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22310  transcriptional regulator, tetR family  45.57 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 125 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  43.14 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  26.24 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  30.24 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.4 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  31.87 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  30.28 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  38.2 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>