More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_22310 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_22310  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 
202 aa  392  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.46 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  37.4 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.89 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.89 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.89 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.89 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.89 
 
 
217 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 
199 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  40.18 
 
 
219 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
245 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
201 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
234 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
237 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.06 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  43.84 
 
 
250 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  27.06 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.06 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  27.06 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.06 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.06 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.06 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.06 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.8 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 
223 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.8 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.8 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  36.26 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 
242 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36720  transcriptional regulator  43.28 
 
 
179 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  34.57 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 
195 aa  52  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 
207 aa  52  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
216 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
200 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
200 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
200 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
212 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
210 aa  51.6  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 
223 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  47.62 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 
261 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 
255 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  25 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
87 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  36.36 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  38.95 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.82 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
234 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>