More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1799 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1799  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1658  TetR family transcriptional regulator  98.98 
 
 		 196 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.166061 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1859  TetR family transcriptional regulator  98.98 
 
 		 196 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1477  transcriptional regulator, TetR family  97.96 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1797  TetR family transcriptional regulator  98.47 
 
 		 196 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125509  normal  0.0456013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0084  TetR family transcriptional regulator  60.51 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.382504  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3762  TetR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 197 aa  228  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4822  TetR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 197 aa  228  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3746  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 197 aa  227  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4730  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 197 aa  227  8e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.88373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4506  TetR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 197 aa  225  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165942  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04117  predicted transcriptional regulator  54.59 
 
 		 197 aa  224  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04081  hypothetical protein  54.59 
 
 		 197 aa  224  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4834  transcriptional regulator, TetR family  54.59 
 
 		 197 aa  224  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5772  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 197 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2967  TetR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699652  normal  0.0717993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 199 aa  98.2  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  30.57 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 195 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 195 aa  87.8  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 182 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 182 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  35.08 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
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NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3330  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
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NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.47 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  29.47 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  40.91 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5842  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25935  normal  0.516433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0851  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1106  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_2927  regulatory protein, TetR  38.85 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
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NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3069  transcriptional regulator, TetR family  41.44 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0746648  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
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NC_011894  Mnod_7468  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23471  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_0620  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_0796  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.091153  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_2181  regulatory protein TetR  33.14 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
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NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  31.52 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
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NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
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NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
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NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  32.52 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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