96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3515 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3515  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000109065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3723  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000134359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 199 aa  51.2  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  30.65 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  20.67 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  19.39 
 
 		 234 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 209 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  23.68 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  20.51 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  29.82 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  29.66 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  19.44 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  22.58 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  24.07 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0237  transcriptional regulator  25 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000134845  hitchhiker  0.00000000249443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  18.75 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  18.75 
 
 		 231 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  20.34 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 393 aa  42  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 190 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 194 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 222 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 184 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 184 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 184 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 232 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 226 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  24.21 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  21.21 
 
 		 225 aa  42  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 182 aa  41.6  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  24.71 
 
 		 225 aa  41.6  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 200 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 497 aa  41.2  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  17.83 
 
 		 242 aa  41.2  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  24.12 
 
 		 194 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 205 aa  40.8  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  22.52 
 
 		 201 aa  40.8  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  19.58 
 
 		 202 aa  40.8  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  21.43 
 
 		 219 aa  41.2  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>