31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4585 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4585  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0832555  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10782  hypothetical protein  34.83 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.882967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4579  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4962  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 203 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.643195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4667  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1722  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.287966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1599  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5158  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5474  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5095  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0948615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5183  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  29.56 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5714  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  44 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 228 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 357 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 220 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 239 aa  42.4  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 216 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 302 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
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NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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