89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5117 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  99.53 
 
 		 211 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 188 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 192 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  38.04 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  34.39 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  28.67 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  29.59 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  26.92 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  32.5 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  24.29 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  35.53 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  32.74 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  32.74 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  32.74 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 177 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  31.78 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5723  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00322286 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  26.22 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 291 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 212 aa  42  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  46.34 
 
 		 203 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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