More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0115 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0465  hypothetical protein  69.85 
 
 		 200 aa  268  5e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  58.55 
 
 		 201 aa  208  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  56.19 
 
 		 239 aa  208  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  57.06 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  38.58 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 204 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  29.91 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  34.44 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.14 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 224 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 309 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  39.02 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  42.62 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  28.12 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 263 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>