91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1140 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 242 aa  477  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1257  regulatory protein TetR  66.81 
 
 		 246 aa  306  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0471441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1361  regulatory protein TetR  56.67 
 
 		 247 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.560408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0882  regulatory protein TetR  57.43 
 
 		 244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3768  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4062  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4023  putative transcriptional regulator, TetR family  52.86 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332964  normal  0.373488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4945  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000126171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2539  TetR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2266  regulatory protein TetR  42.02 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0154  hypothetical protein  37.06 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1098  hypothetical protein  37.5 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3282  hypothetical protein  34.09 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0678  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6153  regulatory protein TetR  27.32 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2820  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 213 aa  62  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1136  hypothetical protein  25.41 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1141  hypothetical protein  25.41 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 194 aa  52.8  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 208 aa  52  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  30.15 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4516  hypothetical protein  26.34 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1779  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.787472  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  31.86 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 204 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  38 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 202 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 223 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 205 aa  45.4  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  39.13 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  29.49 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  34.57 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 388 aa  42.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 192 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 205 aa  42.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  33.77 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 213 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 202 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 214 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 219 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 203 aa  42  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 218 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 203 aa  42  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 218 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 218 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 219 aa  42  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  41.82 
 
 		 204 aa  41.6  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  41.6  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 185 aa  42  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>