32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3282 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3282  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  400  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1098  hypothetical protein  42.78 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2266  regulatory protein TetR  41.4 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0882  regulatory protein TetR  39.09 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1361  regulatory protein TetR  37.25 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.560408  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4062  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3768  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4023  putative transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332964  normal  0.373488 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0154  hypothetical protein  40 
 
 		 217 aa  99.4  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 242 aa  98.2  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1257  regulatory protein TetR  36.69 
 
 		 246 aa  98.2  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0471441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4945  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 283 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000126171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2539  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2820  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6153  regulatory protein TetR  32.18 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0678  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1779  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.787472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4516  hypothetical protein  30.86 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00440  Transcriptional regulatory protein TetR family  36.2 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152406  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0375  rpsU-divergently transcribed protein  32.2 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2449  rpsU-divergently transcribed protein  27.61 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2518  RpsU-divergently transcribed  30.27 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1136  hypothetical protein  21.98 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1141  hypothetical protein  22.28 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0717  hypothetical protein  31.07 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.393861  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0247  hypothetical protein  29.76 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2372  rpsU-divergently transcribed protein  30.51 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0088  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 223 aa  41.2  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>