26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2449 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2449  rpsU-divergently transcribed protein  100 
 
 		 220 aa  427  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2851  RpsU-divergently transcribed  45.97 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541917  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2985  RpsU-divergently transcribed  50.46 
 
 		 275 aa  164  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.633078  normal  0.0413294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2069  rpsU-divergently transcribed protein  44.62 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000110823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3890  RpsU-divergently transcribed  42.71 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0740987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2518  RpsU-divergently transcribed  41.36 
 
 		 236 aa  144  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0247  hypothetical protein  42.46 
 
 		 232 aa  137  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2563  rpsU-divergently transcribed protein  38.16 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2436  rpsU-divergently transcribed protein  38.54 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48636  normal  0.0649596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0717  hypothetical protein  39.06 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.393861  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2372  rpsU-divergently transcribed protein  38.54 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0375  rpsU-divergently transcribed protein  42.19 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2268  rpsU-divergently transcribed protein  42.33 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1045  hypothetical protein  35.42 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0850  hypothetical protein  29.38 
 
 		 196 aa  106  4e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0967  hypothetical protein  25.65 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0156  hypothetical protein  28.65 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.491856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0901  rpsU-divergently transcribed protein  37.79 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3285  rpsU-divergently transcribed protein  34.88 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0760  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03738  conserved hypothetical protein  26.55 
 
 		 280 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0676541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66543  predicted protein  24.44 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428203  normal  0.0596635 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2820  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0882  regulatory protein TetR  31.07 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3282  hypothetical protein  27.61 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1361  regulatory protein TetR  29.61 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.560408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>