24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3285 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3285  rpsU-divergently transcribed protein  100 
 
 		 214 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0375  rpsU-divergently transcribed protein  43.35 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1045  hypothetical protein  41.14 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2372  rpsU-divergently transcribed protein  39.64 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2449  rpsU-divergently transcribed protein  34.88 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0717  hypothetical protein  39.64 
 
 		 230 aa  85.1  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.393861  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2069  rpsU-divergently transcribed protein  35.5 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000110823 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2436  rpsU-divergently transcribed protein  39.73 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48636  normal  0.0649596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3890  RpsU-divergently transcribed  35.53 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0740987 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2985  RpsU-divergently transcribed  33.49 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.633078  normal  0.0413294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2851  RpsU-divergently transcribed  34 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2563  rpsU-divergently transcribed protein  31.31 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2268  rpsU-divergently transcribed protein  35.53 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2518  RpsU-divergently transcribed  36.84 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0247  hypothetical protein  34.64 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0850  hypothetical protein  27.05 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0156  hypothetical protein  29.76 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.491856  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0967  hypothetical protein  21.33 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1779  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.787472  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1136  hypothetical protein  26.51 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0760  hypothetical protein  24.59 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4516  hypothetical protein  31.01 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1141  hypothetical protein  25.9 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2820  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>