23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2436 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2436  rpsU-divergently transcribed protein  100 
 
 		 230 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48636  normal  0.0649596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0717  hypothetical protein  88.55 
 
 		 230 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.393861  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2372  rpsU-divergently transcribed protein  88.11 
 
 		 230 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2518  RpsU-divergently transcribed  61.71 
 
 		 236 aa  287  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0247  hypothetical protein  56.25 
 
 		 232 aa  248  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3890  RpsU-divergently transcribed  60.09 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0740987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2268  rpsU-divergently transcribed protein  49.24 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2069  rpsU-divergently transcribed protein  43.75 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000110823 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2449  rpsU-divergently transcribed protein  38.54 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2563  rpsU-divergently transcribed protein  38.22 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1045  hypothetical protein  42.16 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2851  RpsU-divergently transcribed  39.08 
 
 		 217 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541917  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0375  rpsU-divergently transcribed protein  41.18 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2985  RpsU-divergently transcribed  39.05 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.633078  normal  0.0413294 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0967  hypothetical protein  28.34 
 
 		 213 aa  94.4  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0850  hypothetical protein  28.26 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0156  hypothetical protein  28.88 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.491856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3285  rpsU-divergently transcribed protein  39.73 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03738  conserved hypothetical protein  30.57 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0676541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0901  rpsU-divergently transcribed protein  30 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66543  predicted protein  25.65 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428203  normal  0.0596635 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0760  hypothetical protein  27.85 
 
 		 196 aa  45.8  0.0006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26441  predicted protein  31.36 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169948  normal  0.459367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>