24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2518 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2518  RpsU-divergently transcribed  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0247  hypothetical protein  63.38 
 
 		 232 aa  287  8e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2436  rpsU-divergently transcribed protein  61.71 
 
 		 230 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48636  normal  0.0649596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0717  hypothetical protein  60.36 
 
 		 230 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.393861  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2372  rpsU-divergently transcribed protein  59.91 
 
 		 230 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3890  RpsU-divergently transcribed  61.23 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0740987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2268  rpsU-divergently transcribed protein  49.55 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2563  rpsU-divergently transcribed protein  42.79 
 
 		 225 aa  158  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2069  rpsU-divergently transcribed protein  45.45 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000110823 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2449  rpsU-divergently transcribed protein  41.36 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2851  RpsU-divergently transcribed  43.75 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541917  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1045  hypothetical protein  36.36 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2985  RpsU-divergently transcribed  37.93 
 
 		 275 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.633078  normal  0.0413294 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0375  rpsU-divergently transcribed protein  35.48 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0850  hypothetical protein  29.47 
 
 		 196 aa  95.1  9e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0156  hypothetical protein  28.34 
 
 		 205 aa  88.2  9e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.491856  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0967  hypothetical protein  27.23 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0901  rpsU-divergently transcribed protein  31.34 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3285  rpsU-divergently transcribed protein  36.84 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03738  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0676541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66543  predicted protein  27.78 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428203  normal  0.0596635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3282  hypothetical protein  30.27 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0760  hypothetical protein  28.4 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26441  predicted protein  27.12 
 
 		 238 aa  41.6  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169948  normal  0.459367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>