17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66543 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_66543  predicted protein  100 
 
 		 254 aa  521  1e-147  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428203  normal  0.0596635 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03738  conserved hypothetical protein  33.62 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0676541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0375  rpsU-divergently transcribed protein  26.84 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0717  hypothetical protein  24.29 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.393861  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3890  RpsU-divergently transcribed  32.69 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0740987 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2372  rpsU-divergently transcribed protein  23.81 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2449  rpsU-divergently transcribed protein  24.44 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2069  rpsU-divergently transcribed protein  28.57 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000110823 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2268  rpsU-divergently transcribed protein  24.12 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1045  hypothetical protein  31.86 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2436  rpsU-divergently transcribed protein  25.65 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48636  normal  0.0649596 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0967  hypothetical protein  24.29 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2518  RpsU-divergently transcribed  27.78 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35064  predicted protein  25.83 
 
 		 348 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0247  hypothetical protein  38.46 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0156  hypothetical protein  26.83 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.491856  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2563  rpsU-divergently transcribed protein  22.73 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>