24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0375 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0375  rpsU-divergently transcribed protein  100 
 
 		 218 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1045  hypothetical protein  44.5 
 
 		 224 aa  147  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2851  RpsU-divergently transcribed  40.22 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2449  rpsU-divergently transcribed protein  42.19 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3285  rpsU-divergently transcribed protein  49.04 
 
 		 214 aa  127  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3890  RpsU-divergently transcribed  41.18 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0740987 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2563  rpsU-divergently transcribed protein  37.5 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2436  rpsU-divergently transcribed protein  41.18 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48636  normal  0.0649596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0717  hypothetical protein  43.68 
 
 		 230 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.393861  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2268  rpsU-divergently transcribed protein  39.29 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2985  RpsU-divergently transcribed  44.75 
 
 		 275 aa  112  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.633078  normal  0.0413294 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2372  rpsU-divergently transcribed protein  43.1 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2069  rpsU-divergently transcribed protein  39.01 
 
 		 231 aa  111  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000110823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0247  hypothetical protein  39.58 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0850  hypothetical protein  29.17 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2518  RpsU-divergently transcribed  35.48 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0156  hypothetical protein  29.9 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.491856  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0967  hypothetical protein  25.25 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66543  predicted protein  26.84 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428203  normal  0.0596635 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0760  hypothetical protein  28.95 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03738  conserved hypothetical protein  30.22 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0676541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3282  hypothetical protein  32.2 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0901  rpsU-divergently transcribed protein  31.36 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0154  hypothetical protein  30.88 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>