22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2268 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2268  rpsU-divergently transcribed protein  100 
 
 		 228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2518  RpsU-divergently transcribed  49.55 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0717  hypothetical protein  51.38 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.393861  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2372  rpsU-divergently transcribed protein  50.83 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0247  hypothetical protein  47.89 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2436  rpsU-divergently transcribed protein  49.24 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48636  normal  0.0649596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3890  RpsU-divergently transcribed  51.85 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0740987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2449  rpsU-divergently transcribed protein  42.33 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0375  rpsU-divergently transcribed protein  39.29 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2985  RpsU-divergently transcribed  43.24 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.633078  normal  0.0413294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2069  rpsU-divergently transcribed protein  38.2 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000110823 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2563  rpsU-divergently transcribed protein  37.31 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1045  hypothetical protein  37.31 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2851  RpsU-divergently transcribed  40.96 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541917  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0850  hypothetical protein  29.65 
 
 		 196 aa  105  8e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0156  hypothetical protein  26.9 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.491856  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0967  hypothetical protein  24.62 
 
 		 213 aa  89  6e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0901  rpsU-divergently transcribed protein  37.91 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3285  rpsU-divergently transcribed protein  35.53 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03738  conserved hypothetical protein  29.44 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0676541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66543  predicted protein  24.12 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428203  normal  0.0596635 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0760  hypothetical protein  27.66 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>