23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1045 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1045  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2069  rpsU-divergently transcribed protein  41.63 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000110823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0375  rpsU-divergently transcribed protein  44.5 
 
 		 218 aa  147  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3890  RpsU-divergently transcribed  37.5 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0740987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2518  RpsU-divergently transcribed  36.36 
 
 		 236 aa  128  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2436  rpsU-divergently transcribed protein  42.16 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48636  normal  0.0649596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0247  hypothetical protein  38.76 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2851  RpsU-divergently transcribed  36.95 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541917  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0717  hypothetical protein  41.94 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.393861  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2372  rpsU-divergently transcribed protein  41.4 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2563  rpsU-divergently transcribed protein  34.65 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2449  rpsU-divergently transcribed protein  35.42 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2268  rpsU-divergently transcribed protein  37.31 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_002978  WD0850  hypothetical protein  32.02 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3285  rpsU-divergently transcribed protein  41.14 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2985  RpsU-divergently transcribed  37.04 
 
 		 275 aa  98.2  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.633078  normal  0.0413294 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0156  hypothetical protein  29.17 
 
 		 205 aa  98.2  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.491856  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0967  hypothetical protein  27.78 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03738  conserved hypothetical protein  31.87 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0676541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0760  hypothetical protein  30.61 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66543  predicted protein  31.86 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428203  normal  0.0596635 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26441  predicted protein  27.7 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169948  normal  0.459367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0901  rpsU-divergently transcribed protein  28.8 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>