26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3890 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3890  RpsU-divergently transcribed  100 
 
 		 228 aa  447  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0740987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2518  RpsU-divergently transcribed  61.23 
 
 		 236 aa  271  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0247  hypothetical protein  60.09 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2436  rpsU-divergently transcribed protein  60.09 
 
 		 230 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48636  normal  0.0649596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2372  rpsU-divergently transcribed protein  60.09 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0717  hypothetical protein  60.09 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.393861  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2268  rpsU-divergently transcribed protein  51.85 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2069  rpsU-divergently transcribed protein  47.59 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000110823 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2449  rpsU-divergently transcribed protein  42.71 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2563  rpsU-divergently transcribed protein  40.61 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1045  hypothetical protein  37.5 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2851  RpsU-divergently transcribed  40.11 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.541917  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0375  rpsU-divergently transcribed protein  41.18 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2985  RpsU-divergently transcribed  38.46 
 
 		 275 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.633078  normal  0.0413294 
 
 
-
 
NC_002978  WD0850  hypothetical protein  30.11 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0967  hypothetical protein  29.74 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0156  hypothetical protein  31.55 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.491856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3285  rpsU-divergently transcribed protein  35.9 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0901  rpsU-divergently transcribed protein  32.24 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66543  predicted protein  26.23 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428203  normal  0.0596635 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03738  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0676541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26441  predicted protein  30.51 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169948  normal  0.459367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3282  hypothetical protein  29.14 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0760  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1098  hypothetical protein  27.57 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2266  regulatory protein TetR  28.98 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>