31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2266 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2266  regulatory protein TetR  100 
 
 		 204 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1257  regulatory protein TetR  43.23 
 
 		 246 aa  143  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0471441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0882  regulatory protein TetR  44.26 
 
 		 244 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  42.02 
 
 		 242 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1361  regulatory protein TetR  41.85 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.560408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4945  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000126171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4062  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 257 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3768  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 257 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4023  putative transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332964  normal  0.373488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3282  hypothetical protein  41.4 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0154  hypothetical protein  43.18 
 
 		 217 aa  121  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1098  hypothetical protein  39.78 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2539  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0678  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943955  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1141  hypothetical protein  26.63 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1136  hypothetical protein  26.79 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1779  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.787472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6153  regulatory protein TetR  27.74 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2820  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 210 aa  42  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 187 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  43.64 
 
 		 191 aa  42  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 197 aa  42  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>