48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2820 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2820  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1779  TetR family transcriptional regulator  52.72 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.787472  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1141  hypothetical protein  45.7 
 
 		 203 aa  171  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1136  hypothetical protein  45.7 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0088  TetR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4516  hypothetical protein  41.85 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00440  Transcriptional regulatory protein TetR family  44.77 
 
 		 188 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152406  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3282  hypothetical protein  29.02 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6153  regulatory protein TetR  31.78 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1257  regulatory protein TetR  27.84 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0471441 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2266  regulatory protein TetR  27.68 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2539  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4023  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332964  normal  0.373488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0882  regulatory protein TetR  25.84 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2449  rpsU-divergently transcribed protein  23.12 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4062  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3768  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4945  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 283 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000126171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1361  regulatory protein TetR  26.7 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.560408  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  30.3 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1098  hypothetical protein  24.62 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3285  rpsU-divergently transcribed protein  30.97 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  34.33 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 453 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 242 aa  42  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0717  hypothetical protein  26.44 
 
 		 230 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.393861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 250 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 189 aa  41.6  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>