42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6153 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6153  regulatory protein TetR  100 
 
 
199 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2539  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
242 aa  92  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4023  putative transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 
259 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332964  normal  0.373488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4062  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
257 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3768  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
257 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0882  regulatory protein TetR  31.9 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170923  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4945  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000126171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1361  regulatory protein TetR  28.12 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.560408  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1257  regulatory protein TetR  25.14 
 
 
246 aa  68.2  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0471441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3282  hypothetical protein  32.18 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2820  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
213 aa  61.6  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2266  regulatory protein TetR  27.74 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1098  hypothetical protein  29.38 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176641  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1779  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
206 aa  48.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.787472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
202 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  32.93 
 
 
233 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  33.33 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
235 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
235 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
235 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
231 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
235 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
225 aa  45.1  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
235 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
193 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
260 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
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NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  29.91 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
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NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  37.1 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
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NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  30.43 
 
 
238 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
189 aa  42.4  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  32.26 
 
 
238 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 
194 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.293374 
 
 
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NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
72 aa  41.6  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
254 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
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NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
211 aa  41.6  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.627174 
 
 
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NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
243 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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