23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3768 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3768  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4062  TetR family transcriptional regulator  99.22 
 
 		 257 aa  494  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4023  putative transcriptional regulator, TetR family  90.04 
 
 		 259 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332964  normal  0.373488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4945  TetR family transcriptional regulator  80.89 
 
 		 283 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000126171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1361  regulatory protein TetR  78.73 
 
 		 247 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.560408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0882  regulatory protein TetR  82.67 
 
 		 244 aa  329  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1257  regulatory protein TetR  54.46 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0471441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2539  TetR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 242 aa  141  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2266  regulatory protein TetR  42.7 
 
 		 204 aa  128  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3282  hypothetical protein  37.85 
 
 		 214 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1098  hypothetical protein  38.64 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6153  regulatory protein TetR  32.94 
 
 		 199 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0154  hypothetical protein  32.16 
 
 		 217 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0678  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2820  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>