144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0103 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0103  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  80.75 
 
 		 217 aa  309  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 211 aa  270  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 211 aa  270  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 211 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  52.72 
 
 		 280 aa  201  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  25.95 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  25 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  25 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  25 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  25 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  25 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  24.84 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  24.84 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 229 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 461 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 200 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 260 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  21.92 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 201 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 227 aa  44.7  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1423  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 209 aa  44.7  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 254 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 254 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 254 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 254 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 254 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 254 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 254 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  34.62 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 233 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  25.77 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 248 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 248 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 240 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>