291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4338 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4338  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 231 aa  441  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  44.4 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0548  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  31.19 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 286 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3709  regulatory protein TetR  31.51 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 185 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 241 aa  48.5  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  35.63 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 188 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 188 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 188 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 98 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  38.36 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  35.38 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 192 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 185 aa  45.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>