More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4323 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 201 aa  388  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  93.03 
 
 		 201 aa  345  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  61.14 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  57.65 
 
 		 195 aa  194  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 207 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  50.26 
 
 		 202 aa  171  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  47.42 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  44.56 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  44.79 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  43.23 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  37.44 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 221 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2791  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0498078  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  39.66 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  30.93 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 141 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  40.79 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.72 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0756  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0490671  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 242 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  32.56 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 172 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  40 
 
 		 264 aa  48.5  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  48.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 189 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>