More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2791 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2791  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 179 aa  353  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0498078  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  52.87 
 
 		 195 aa  147  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  43.09 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36720  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 179 aa  114  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0756  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 206 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0490671  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36230  transcriptional regulator, tetR family  32.24 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  50 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 199 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  43.21 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  31.15 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 240 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 223 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 238 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 216 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 200 aa  52  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 211 aa  51.6  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 183 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 206 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 208 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 201 aa  51.2  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 201 aa  51.2  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 200 aa  51.2  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 243 aa  51.2  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 216 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 213 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 188 aa  50.8  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 210 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 207 aa  50.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  47.83 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 255 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 346 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  46.94 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 400 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  36.11 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  35.9 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  39.44 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 260 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 269 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 287 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 332 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 209 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 219 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 219 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 258 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 219 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 231 aa  48.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  46.51 
 
 		 186 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  48.98 
 
 		 208 aa  48.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  43.48 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 221 aa  48.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 215 aa  48.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 200 aa  48.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  40 
 
 		 222 aa  47.8  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 214 aa  47.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>