More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36720 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36720  transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  360  7.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  45.03 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2791  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 179 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0498078  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0756  transcriptional regulator, TetR family  38.06 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0490671  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 186 aa  94.4  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36230  transcriptional regulator, tetR family  34.93 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22310  transcriptional regulator, tetR family  43.28 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 211 aa  52  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 245 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  32.04 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 244 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 218 aa  51.2  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 265 aa  51.2  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 217 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  31.58 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 280 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 357 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 307 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  47.06 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  38.1 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  48.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 200 aa  48.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 192 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 192 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 258 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 239 aa  47.8  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 225 aa  47.8  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 248 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  38.81 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 209 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 209 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 310 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  30.68 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 246 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 207 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 446 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  45.1 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>